Guías de la BUH: Datos de investigación: Zenodo

Zenodo

Zenodo es un repositorio de propósito general donde se pueden depositar, entre otros, datos de investigación en acceso abierto y está respaldado por fondos de la Unión Europea y gestionado desde el centro de datos del CERN. En el marco del programa Horizonte Europa, las entidades de financiación establecen ciertas responsabilidades para los beneficiarios, entre las cuales se incluyen la implementación de un plan de gestión de datos, el cumplimiento de los requisitos FAIR para los datos, el depósito de éstos en repositorios confiables, la elección de licencias abiertas CC-BY o CC-0, y la provisión de metadatos abiertos con licencia CC-0.

Además, el X Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica de Innovación 2024-2027 aboga por el acceso abierto a los resultados de actividades subvencionadas, tanto en términos de publicaciones como de datos. También enfatiza la importancia de cumplir con los principios FAIR para los datos y, siempre que sea posible, difundirlos de manera abierta.

Algunas características de Zenodo son:

cada depósito recibe un Identificador de Objeto Digital (DOI) que permite citarlo y rastrearlo fácilmente
admite versionado
se integra con GitHub
las publicaciones están disponibles en OpenAire
El tamaño máximo de archivo es de 50Gb.

Para más información sobre datos de investigación puede consultar la Guía de Datos de Investigación de la BUH

La Biblioteca Universitaria de Huelva ha creado una comunidad UHU en Zenodo para que el personal investigador de nuestra universidad deposite ahí sus datos de investigación vinculados a publicaciones. De esta forma, a los/as investigadores/as de la UHU que quieran poner sus datos de investigación de forma abierta o necesiten cumplir con requerimientos de editores, instituciones o mandatos de financiadores, se les recomienda que depositen los datos de investigación en este repositorio multidisciplinar.

Está comunidad de la UHU está orientada a depositar datasets vinculados a publicaciones científicas y proyectos de investigación. Su finalidad no es convertirse en un lugar de almacenamiento masivo de datos de investigación primarios sino principalmente datos finales y procesados.

Además, al contar con una comunidad específica para datos de investigación en Zenodo para la Universidad de Huelva, también se está favoreciendo disponer de un punto único de consulta de los datos de investigación de la UHU.

Todo lo anterior, sin excluir la posibilidad de depositar datos de investigación vinculados a trabajos científicos de la UHU en el Repositorio Académico Institucional Arias Montano o bien en otros repositorios temáticos que permitan incrementar la visibilidad.

Zenodo es un repositorio mundial multidisciplinar con ventajas como un entorno seguro, formatos estandarizados y accesibilidad. Su propósito es general y en él se pueden depositar, entre otros, datos de investigación en acceso abierto. Se integra en OpenAire, está respaldado por fondos de la Unión Europea y gestionado desde el centro de datos del CERN.

Por otra parte, el contar con una comunidad específica de la UHU podrá contribuir a una mayor difusión y visibilidad de los datos de investigación, al contar con un espacio único.

Además, también es posible depositar datos de investigación en el Repositorio Institucional Arias Montano. Consulte con el personal bibliotecario.

Pasos a seguir en Zenodo

1. Registro de usuario en Zenodo

Recomendamos visualizar el Tutorial Zenodo: Registro y subida de datos de la UCLM. Disponible en https://www.youtube.com/watch?v=wsKwZxEiOTI

Básicamente hay tres opciones de registro:

a) Crear cuenta en Zenodo mediante ORCID

b) Crear cuenta en Zenodo mediante usuario y contraseña

c) Crear cuenta mediante OpenAire

2. Depósito en Zenodo de los ficheros de datos de investigación:

Una vez se está identificado en Zenodo, entramos en la comunidad UHU: y se pulsa en el botón "New Upload"

Se trata ahora de subir el/los ficheros de datos.

Atención, el archivo que se suba es definitivo, no puede ser modificado por el equipo bibliotecario

Es importante:

Ofrecer versiones de los ficheros de datos en formatos abiertos para favorecer la reutilización de los datos.
Subir también un fichero readme.txt, que recogerá información sobre la autoría, título, metodología, breve descripción del conjunto de datos, derechos de uso, etc. Se debe publicar en inglés, para asegurar un mayor alcance dentro de la comunidad investigadora.

Guía para elaborar plantillas reame Universidad de Cornell https://data.research.cornell.edu/data-management/sharing/readme/

Plantilla para el readme.txt: ejemplo de plantilla del achivo readme.txt, elaborada por la Biblioteca de Economía y Empresa de la UDC.

3. Asignar los metadatos descriptivos.

Después de subir los ficheros hay que rellenar los metadatos descriptivos (tipo de documento, autoría, título, fecha , idioma, palabras clave…). El siguiente paso es definir el tipo de acceso y la licencia que se asigna a los datos. Es obligatorio seleccionar una licencia y por defecto Zenodo ofrece una Creative Commons Attribution 4.0 international:

En el caso de que esos datos sean resultado de algún proyecto con financiación institucional (UE, Ministerio) también debe recogerse en Zenodo, para así posibilitar el seguimiento de las obligaciones de publicación de datos en abierto que requieren en muchos casos los financiadores:

A la hora de cumplimentar estos metadatos

DOI :Si los datos ya tenían DOI hay que especificarlo, en caso contrario se marca no y el sistema otorga un DOI
Tipo de recurso. Hay que seleccionar del desplegable "Dataset"
Título
Fecha de publicación.
Creadores. Los autores del conjunto de datos. Al pulsar en la opción aparece una ventana donde se han de completar los detalles del autor. Se puede hacer una búsqueda, por si existiera ya en Zenodo o bien añadir los datos manualmente.
Resumen en inglés y/o castellano.
Una licencia Creative Commons que para datos ha de ser atribución CC-BY o CC-0 (dominio público).
El campo contributors se puede usar para añadir información sobre sobre las personas u organizaciones que han colaborado.
El campos Keywords e idioma y fecha. especificar las palabras clave del conjunto de datos así como el idioma del mismo. Y en el campo date se especifica la fecha de toma de datos.
El campo versión se usa para especificar la versión del conjunto de datos.
En el campo funding se especifican las agencias de financiación y el código de proyecto (award number). Utilizar Add award para especificarlo, si no aparece en los desplegables de este botón, se puede añadir manualmente con Add custom.
El campo Alternate idenfiers se utiliza para indicar otros idenficadores alternativos al DOI, si por ejemplo el conjunto de datos fue publicado en otro repositorio.
El campo Related works se usa para especificar otros conjuntos de datos o publicaciones relacionadas. Por ejemplo si el conjunto de datos forma parte de un artículo se usa la relación "is part of", luego se añade el DOI, se selecciona del desplegable el esquema DOI y el tipo de recurso.

Una vez que se completa el depósito en la comunidad de la UHU, la Biblioteca recibe un aviso de que hay un nuevo depósito. Se revisan los metadatos y se valida el registro para que sea visible desde la comunidad Zenodo de la UHU.

4. ¿Cómo mover un dataset ya depositado en Zenodo a una comunidad en concreto?

Ver instrucciones https://help.zenodo.org/docs/share/submit-to-community/

Basado en https://biblioguias.upct.es/publicar-datos-investigacion/como-publicar-datos

Recomendamos específicamente:

Hacer uso de la Comunidad para datos de investigación relacionados con resultados científicos publicados. La utilidad principal es que estén vinculados a un resultado.

Tener en cuenta su utilidad en el contexto de las convocatorias de Sexenios. Desde 2023, los datasets son también una aportación a sexenios.

Los datasets deben de ser conjuntos de datos limpios y procesados, preferentemente datos finales.

El depósito de datasets en Zenodo corresponde siempre al investigador/a. No hay archivo delegado. El equipo bibliotecario básicamente revisarán y mejorará metadatos si es posible.

Dado que quien conoce los datasets son los propios investigadores. Animamos a trabajar lo mejor posible los ficheros readme.txt.

Recomendamos que se preste especial atención a los metadatos de trabajos vinculados y de proyectos de financiación.

Por otra parte, son recomendaciones generales:

Es relevante conocer las tipologías de datos, que son muy variadas

Y también manejarse correctamente en el tratamiento de estos datos, siendo relevantes cuestiones como el nombrado de ficheros, almacenamiento, procesos de anonimización y pseudoanonimización. A este respecto recomendamos datos.gob.es con gran cantidad de documentación de ayuda. Disponible en su apartado Documentación: https://datos.gob.es/es/documentacion

Respecto al nombrado y renombrado de ficheros, existen herramientas que ayudan a la tarea de renombrar múltiples ficheros:

Respecto al tratamiento de datos

Guía práctica para la publicación de datos tabulares en archivos csv.

Herramienta para refinado y conversión de datos datos: OpenRefine

Respecto a anonimización, destacamos:

Guía básica de anonimización y la nota técnica sobre la k-anonimidad. de la Agencia de Protección de datos

Por su parte, OpenAire facilia la herramienta Amnesia para la anonimización de datos.

Para ampliar información

Recomendamos la Guía de la Biblioteca Universitaria Pablo de Olavide sobre Datos de Investigación, que profundiza en aspectos de organización, tratamiento, procesamiento y seguridad de los datos. Disponible en https://guiasbib.upo.es/gestion_datos_de_investigacion

Guía oficial de Ayuda de Zenodo

Guía Zenodo